UCSC Rat Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
RGD Gene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CalcrRGD:621001
    
    
     
0chr4 28,523,736receptor for calcitonin; acts via adenylate cyclase signaling
2Oprk1RGD:69426
    
    
     
n/achr5 14,048,060a class of opioid receptors; show selective affinity for the endogenous opioid dynorphin
3Slc18a3RGD:62072
    
    
     
n/achr16 7,971,168a vesicular acetylcholine transporter involved in concentrating acetylcholine into synaptic vesicles
4LOC690319RGD:1597369
    
    
     
n/achr6 127,983,152n/a
5Klk1c10RGD:1561403
    
    
     
n/achr1 94,382,675n/a
6Prb1RGD:628797
    
    
     
n/achr4 169,584,946member of a family of proline rich proteins that are induced in salivary gland by isoproterenol treatment and by feeding tannins
7AhrRGD:2074
    
    
     
n/achr6 54,222,686binds 3-methylcholanthrene and other aromatic hydrocarbons; may play a role in bone formation
8P22k15RGD:727814
    
    
     
n/achr3 138,333,202putative cysteine proteinase inhibitor
9Olr1082RGD:727865
    
    
     
n/achr7 12,193,152member of the olfactory receptor family
10InhaRGD:2912
    
    
     
n/achr9 74,782,673alpha subunit of protein hormone that inhibits the secretion of FSH from pituitary gonadotrophs
11Fgf7RGD:61805
    
    
     
n/achr3 113,492,982mediates glucocorticoid induction of fetal lung maturation; involved in regulation of surfactant synthesis
12SlkRGD:3780
    
    
     
n/achr1 252,980,922putative serine/threonine protein kinase
13Slc10a1RGD:3681
    
    
     
n/achr6 104,742,651mediates sodium dependent bile acid transport
14Slc29a1RGD:61899
    
    
     
n/achr9 11,007,484nucleoside transporter
15RGD1562284RGD:1562284
    
    
     
n/achr6 1,861,924n/a
16FevRGD:628860
    
    
     
n/achr9 74,216,701transcriptional regulator of downstream target genes involved in cholinergic neurotransmission
17Ntrk1RGD:620144
    
    
     
n/achr2 179,847,142a protooncogene; receptor that binds to nerve growth factor (NGF)
18LOC688786RGD:1585222
    
    
     
n/achr12 2,532,336n/a
19Hsd17b3RGD:621805
    
    
     
n/achr17 6,569,844catalyzes the final step of testosterone biosynthesis in the testis
20RGD1563746RGD:1563746
    
    
     
n/achr10 91,788,307n/a
21Scn5aRGD:3637
    
    
     
n/achr8 124,495,890acts as a tetrodotoxin-resistant voltage gated sodium channel; may play a role in cardiac function
22St8sia3RGD:3680
    
    
     
n/achr18 60,471,018alpha2-8 sialyltransferase, a key enzyme for the synthesis of c-series gangliosides
23RGD1307882RGD:1307882
    
    
     
n/achr8 100,584,758n/a
24Pom121RGD:620680
    
    
     
n/achr12 22,440,057may act to anchor components of the nuclear complex to the pore membrane domain of the nuclear envelope
25Scgb2a2RGD:735031
    
    
     
n/achr1 212,299,399one of three polypeptides which make up prostatic steroid-binding protein, the predominant protein secreted into rat prostatic fluid
26RGD1311739RGD:1311739
    
    
     
n/achr3 118,858,460n/a
27TpbpaRGD:621454
    
    
     
n/achr17 9,485,773a secretory protein that may play a role in spongiotrophoblast cells during the latter half of pregnancy
28Nkx2-1RGD:3866
    
    
     
n/achr6 76,918,538transcription factor that binds and activates the promoter of thyroid specific genes such as thyroglobulin, thyroperoxidase, and thyrotropin receptor; may play a role in organogenesis and/or reproductive maturation and development
29RGD1562234RGD:1562234
    
    
     
n/achr2 183,500,634n/a
30Olr1226RGD:1332728
    
    
     
n/achr8 40,432,648predicted member of the olfactory receptor family
31Mmp3RGD:621317
    
    
     
n/achr8 4,322,373encodes a member of the metalloproteinase family involved in female pregnancy, wound healing, and several other biological processes; associated with aortic aneurysm, liver cirrhosis, dermatitis, allergic contact and other diseases  
32Pou2f3RGD:621691
    
    
     
n/achr8 46,166,813may play a role in epidermal development; variant Skn-1i inhibits Oct1 transactivation; variant Skn1a activates cytokeratin 10 (K10) gene expression
33Wdr31RGD:1309367
    
    
     
n/achr5 79,451,957n/a
34Col10a1RGD:2371
    
    
     
n/achr20 38,728,338extracellular matrix collagen protein; may participate in regulation of Meckel's cartilage development
35Olr737RGD:1334287
    
    
     
n/achr3 74,612,770predicted member of the olfactory receptor family
36DpysRGD:68376
    
    
     
n/achr7 75,407,199enzyme that catalyzes the conversion of 5,6-dihydrouracil to 3-ureidopropionate in pyrimidine metabolism
37Muc1RGD:3122
    
    
     
n/achr2 181,401,561encodes a membrane bound, glycosylated protein belonging to the mucin family; involved in female pregnancy, response to hypoxia, response to retinoic acid; associated with Cholangiocarcinoma; human homolog associated with many cancers
38Aldh5a1RGD:621422
    
    
     
n/achr17 47,204,953succinic semialdehyde dehydrogenase; involved in the degradation of the inhibitory neurotransmitter GABA
39Scn7aRGD:61922
    
    
     
n/achr3 48,672,018glial Na-channel alpha subunit
40Hoxa2RGD:2813
    
    
     
n/achr4 80,463,789homeobox transcription factor; may be involved in control of vascular smooth muscle differentiation and proliferation
41FgaRGD:2603
    
    
     
n/achr2 174,745,619plays a role in blood coagulation; may be involved in liver regeneration
42Ecel1RGD:61806
    
    
     
n/achr9 85,939,988damage-induced neuronal metallo-endopeptidase; involved in neuroprotection
43Atp7aRGD:2179
    
    
     
n/achrX 94,221,158may play a role in copper ion transport
44Lrch4RGD:1306145
    
    
     
n/achr12 19,699,928n/a
45Olr728RGD:1333993
    
    
     
n/achr3 74,436,627predicted member of the olfactory receptor family
46RGD1565493RGD:1565493
    
    
     
n/achr7 71,586,003n/a
47HcrtRGD:2786
    
    
     
n/achr10 89,700,240neuropeptide; involved in feeding behavior and hormone secretion regulation
48StrnRGD:3782
    
    
     
n/achr6 1,469,682calmodulin-binding protein involved in dendrite development and locomotory behavior; associated with traumatic brain injury
49Olr857RGD:1333749
    
    
     
n/achr5 139,166,763predicted member of the olfactory receptor family
50Gja1RGD:2690
    
    
     
n/achr20 35,416,038component of gap junctions; plays a role in cell-cell communication; mutation in human gene associated with oculodentodigital dysplasia, and deafness